Część powstających inwestycji na różnych etapach swojego cyklu życiowego może powodować wystąpienie negatywnego oddziaływania na chronione elementy środowiska, w tym nietoperze. Może dotyczyć ono niszczenia kryjówek, zajmowania terenów żerowisk, tworzenia bariery na trasie przelotów lub powodowania bezpośredniej śmiertelności.